DERSİN TÜRÜ	Zorunlu
DERSİN DÜZEYİ	Lisans
DERSİN YILI	4
YARIYIL	Yedinci Yarıyıl (Güz)
AKTS	5
ÖĞRETİM ELEMAN(LAR)I	Öğretim Görevlisi Fatma Şeyma Gökdemir
DERSİN ÖĞRENME KAZANIMLARI	Bu dersin sonunda öğrenciler; 1) Biyoinformatiğin kapsamıı, biyolojik veritabanlarını, dizi hizalama ve veritabanlarında benzerlik taramasının temel prensiplerini ve temel algoritmalarını açıklar. 2) Düzenleyici bölge tahminleme analizlerini yapar ve yorumlar. 3) Protein yapı analizlerini ve üç boyutlu tahminleme metotlarını açıklar. 4) Gen ifadeleme analizlerini bilir ve sonuçlarını yorumlar. 5) Gen ya da proteinler arasındaki ilişkileri ağ biyolojisi ile analiz eder. 6) Genom haritalama ve karşılaştırma analizlerini öğrenerek verileri yorumlar.
DERSİN VERİLİŞ BİÇİMİ	Yüz Yüze
DERSİN ÖNKOŞULLARI	Yok
ÖNERİLEN DERSLER	Yok
DERS TANIMI	Biyoinformatik, biyolojik verilerin anlamlandırılması, saklanması, görsellenmesi ve bu devasa bilgi birikiminden azami ölçüde yararlanabilmek amacıyla, matematik, istatistik, bilgisayar bilimleri, moleküler biyoloji ve genetik alanlarının sentezidir. Bir diğer tanımla, karmaşık biyolojik verilerin derlenmesi ve analiz edilmesi bilimidir.
DERS İÇERİĞİ	HAFTA KONULAR 1. Hafta Biyoinformatik Tanım ve Kapsam 2. Hafta Biyolojik Veritabanları 3. Hafta Dizi Hizalama 4. Hafta Veritabanlarında Benzerlik 5. Hafta Temel Algoritmalar 6. Hafta Gen Tahminleme 7. Hafta Promotör ve Düzenleyici Bölge Tahminlemeleri 8. Hafta ARA SINAV 9. Hafta Protein Yapı Analizleri ve Üç Boyutlu Tahminleme 10. Hafta Gen İfadeleme Analizleri 11. Hafta Kodlanmayan RNA Analizi 12. Hafta Ağ Biyolojisi 13. Hafta Genom Haritalama ve Karşılaştırma 14. Hafta Tartışma
ZORUNLU YA DA ÖNERİLEN KAYNAKLAR	Essential Bioinformatics, Jin Xiong. Cambridge University Press, 2006. Bioinformatics For Biologists, Pavel Pevzner and Ron Shamir, Cambridge University Press, 2011. Essentials of Bioinformatics, Volume I, Understanding Bioinformatics: Genes to Proteins, Editors: Shaik, N.A., Hakeem, K.R., Banaganapalli, B., Elango, R. Springer, 2019.
ÖĞRETİM YÖNTEM VE TEKNİKLERİ	Anlatım,Tartışma,Eğitim-Uygulama,Soru-Cevap
DEĞERLENDİRME YÖNTEMİ VE GEÇME KRİTERLERİ	Sayısı Toplam Katkısı(%) Ara Sınav 1 35 Ödev 12 10 Proje 1 15 Toplam(%) 60 Yıl İçinin Başarıya Oranı(%) 60 Finalin Başarıya Oranı(%) 40 Toplam(%) 100
AKTS İŞ YÜKÜ	Aktivite Sayı Süresi(Saat) İş Yükü Ara Sınav 1 2 2 Kısa Sınavlara hazırlık Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi Final Sınavına Hazırlık 1 30 30 Ders Saati 13 2 26 Ara Sınava Hazırlık 1 25 25 Laboratuvar Final Sınavı 1 2 2 Ödevler 12 3 36 Proje 1 8 8 Uygulama 13 2 26 Toplam İş Yükü 155 Toplam İş Yükü / 30 5,16 Dersin AKTS Kredisi 5
DİL	Türkçe
STAJ / UYGULAMA	Yok