Bu dersin sonunda öğrenciler; 1) Birinci, ikinci ve üçüncü nesil sekanslama yöntemlerini öğrenir. 2) NGS servis sağlayıcıları, DNA ve RNA data analizlerini ve depolamayı öğrenir. 3) NGS uygulamaları ve etkilerini öğrenir. 4) tek hücre omiks teknolojilerini öğrenir.
DERSİN VERİLİŞ BİÇİMİ
Yüz Yüze
DERSİN ÖNKOŞULLARI
Yok
ÖNERİLEN DERSLER
Yok
DERS TANIMI
Bu ders, omiks teknolojilerinin tarihini, birinci, ikinci ve üçüncü nesil dizileme yöntemlerini, NGS servis sağlayıcıları, DNA ve RNA data analizlerini ve depolamayı, NGS uygulama ve etkilerini ve tek hücre omiks teknolojilerini kapsar.
DERS İÇERİĞİ
HAFTA
KONULAR
1. Hafta
Omiks teknolojilerinin tarihini
2. Hafta
Birinci, ikinci ve üçüncü nesil dizileme yöntemleri I
3. Hafta
Birinci, ikinci ve üçüncü nesil dizileme yöntemleri II
4. Hafta
Birinci, ikinci ve üçüncü nesil dizileme yöntemleri III
5. Hafta
NGS servis sağlayıcıları, DNA ve RNA data analizleri I
6. Hafta
NGS servis sağlayıcıları, DNA ve RNA data analizleri II
7. Hafta
Veri depolama
8. Hafta
Öğrenci sunumları
9. Hafta
NGS uygulamaları I
10. Hafta
NGS uygulamaları II
11. Hafta
Tek hücre omiks teknolojileri
12. Hafta
Tek hücre omiks teknolojileri
13. Hafta
Öğrenci sunumları
14. Hafta
Öğrenci sunumları
ZORUNLU YA DA ÖNERİLEN KAYNAKLAR
Next Generation Sequencing: Advances, Applications and Challenges, Ed. Jerzy Kulski, 2016, InTech, 2012.
