Anasayfa  »  Fen Edebiyat Fakültesi »  Moleküler Biyoloji ve Genetik Programı (Türkçe)

DERS ADIDERS KODUYARIYILTEORİ + UYGULAMA (Saat)AKTS
BİYOİNFORMATİK II MBG414 - 2 + 2 4

DERSİN TÜRÜSeçmeli
DERSİN DÜZEYİLisans
DERSİN YILI-
YARIYIL-
AKTS4
ÖĞRETİM ELEMAN(LAR)I-
DERSİN ÖĞRENME KAZANIMLARI Bu dersin sonunda öğrenciler;
1) Biyolojik veritabanlarını, ileri ve çoklu dizi hizalamalarını, hizalama algoritmalarını ve modellerini anlar.
2) İleri dizi ve bölge tahminleme ve filogenetik ağaç uygulamalarını bilir.
3) Protein ve RNA ikincil yap tahminleme çalışmalarını anlar.
4) Ders içeriğinin bilgisayardaki tüm uygulamalarını yapabilir, ilgi alanı doğrultusunda çalışma yapabilir ve sonuçlarını tartışabilir.
DERSİN VERİLİŞ BİÇİMİYüz Yüze
DERSİN ÖNKOŞULLARIYok
ÖNERİLEN DERSLERYok
DERS TANIMIBiyoinformatik, biyolojik verilerin anlamlandırılması, saklanması, görsellenmesi ve bu devasa bilgi birikiminden azami ölçüde yararlanabilmek amacıyla, matematik, istatistik, bilgisayar bilimleri, moleküler biyoloji ve genetik alanlarının sentezini içeren konular bütünlüğünde, karmaşık biyolojik verilerin derlenmesi ve analiz edilmesi, öğrencilerin multidisipliner bakış açısı kazanması, aynı zamanda genomik ve proteomik veriler arasındaki yaklaşımlarla ilişki kurması amaçlanmaktadır.
DERS İÇERİĞİ
HAFTAKONULAR
1. Hafta Biyolojik Veritabanları
2. Hafta Çoklu Dizi Hizalama ve Modeller
3. Hafta Bilgisayar Uygulaması
4. Hafta Promotör ve Düzenleyici Bölge Tahminlemeleri
5. Hafta Protein Dizi Motifleri ve Bölge Tahminleme
6. Hafta Bilgisayar Uygulaması
7. Hafta Filogenetik Ağaç Oluşturma Yöntemleri ve Programlar
8. Hafta ARA SINAV
9. Hafta Bilgisayar Uygulaması
10. Hafta Protein Yapılarının Karşılaştırılması
11. Hafta Protein Yapı Tahminlemeleri
12. Hafta İkincil RNA Yapı Tahminlemeleri
13. Hafta Bilgisayar Uygulaması
14. Hafta Öğrenci Projeleri ve Tartışma
ZORUNLU YA DA ÖNERİLEN KAYNAKLAREssential Bioinformatics. Jin Xiong. Cambridge University Press, 2006.
ÖĞRETİM YÖNTEM VE TEKNİKLERİAnlatım,Tartışma,Eğitim-Uygulama,Proje
DEĞERLENDİRME YÖNTEMİ VE GEÇME KRİTERLERİ
 SayısıToplam Katkısı(%)
Ara Sınav135
Uygulama/Pratik125
Toplam(%)60
Yıl İçinin Başarıya Oranı(%)60
Finalin Başarıya Oranı(%)40
Toplam(%)100
AKTS İŞ YÜKÜ
Aktivite Sayı Süresi(Saat) İş Yükü
Ara Sınav122
Kısa Sınavlara hazırlık
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi14114
Final Sınavına Hazırlık13030
Ders Saati13226
Ara Sınava Hazırlık12525
Laboratuvar
Final Sınavı122
Ödevler
Uygulama13226
Toplam İş Yükü125
Toplam İş Yükü / 304,16
Dersin AKTS Kredisi4
DİLTürkçe
STAJ / UYGULAMAYok
  

PROGRAM YETERLİLİKLERİ (P) / DERSİN ÖĞRENME KAZANIMLARI (Ö) MATRİSİ
Ö1Ö2Ö3Ö4
P1       
P2  X   X   X  
P3       
P4  X   X   X  
P5  X   X   X  
P6        X
P7        X
P8  X   X   X   X
P9  X   X   X   X
P10  X   X   X   X
P11        X
P12        X
P13