DERSİN TÜRÜ | Seçmeli |
DERSİN DÜZEYİ | Lisans |
DERSİN YILI | - |
YARIYIL | - |
AKTS | 4 |
ÖĞRETİM ELEMAN(LAR)I | -
|
DERSİN ÖĞRENME KAZANIMLARI |
Bu dersin sonunda öğrenciler; 1) Biyolojik veritabanlarını, ileri ve çoklu dizi hizalamalarını, hizalama algoritmalarını ve modellerini anlar. 2) İleri dizi ve bölge tahminleme ve filogenetik ağaç uygulamalarını bilir. 3) Protein ve RNA ikincil yap tahminleme çalışmalarını anlar. 4) Ders içeriğinin bilgisayardaki tüm uygulamalarını yapabilir, ilgi alanı doğrultusunda çalışma yapabilir ve sonuçlarını tartışabilir.
|
DERSİN VERİLİŞ BİÇİMİ | Yüz Yüze |
DERSİN ÖNKOŞULLARI | Yok |
ÖNERİLEN DERSLER | Yok |
DERS TANIMI | Biyoinformatik, biyolojik verilerin anlamlandırılması, saklanması, görsellenmesi ve bu devasa bilgi birikiminden azami ölçüde yararlanabilmek amacıyla, matematik, istatistik, bilgisayar bilimleri, moleküler biyoloji ve genetik alanlarının sentezini içeren konular bütünlüğünde, karmaşık biyolojik verilerin derlenmesi ve analiz edilmesi, öğrencilerin multidisipliner bakış açısı kazanması, aynı zamanda genomik ve proteomik veriler arasındaki yaklaşımlarla ilişki kurması amaçlanmaktadır. |
DERS İÇERİĞİ | HAFTA | KONULAR |
---|
1. Hafta | Biyolojik Veritabanları | 2. Hafta | Çoklu Dizi Hizalama ve Modeller | 3. Hafta | Bilgisayar Uygulaması | 4. Hafta | Promotör ve Düzenleyici Bölge Tahminlemeleri | 5. Hafta | Protein Dizi Motifleri ve Bölge Tahminleme | 6. Hafta | Bilgisayar Uygulaması | 7. Hafta | Filogenetik Ağaç Oluşturma Yöntemleri ve Programlar | 8. Hafta | ARA SINAV | 9. Hafta | Bilgisayar Uygulaması | 10. Hafta | Protein Yapılarının Karşılaştırılması | 11. Hafta | Protein Yapı Tahminlemeleri | 12. Hafta | İkincil RNA Yapı Tahminlemeleri | 13. Hafta | Bilgisayar Uygulaması | 14. Hafta | Öğrenci Projeleri ve Tartışma |
|
ZORUNLU YA DA ÖNERİLEN KAYNAKLAR | Essential Bioinformatics. Jin Xiong. Cambridge University Press, 2006. |
ÖĞRETİM YÖNTEM VE TEKNİKLERİ | Anlatım,Tartışma,Eğitim-Uygulama,Proje |
DEĞERLENDİRME YÖNTEMİ VE GEÇME KRİTERLERİ | | Sayısı | Toplam Katkısı(%) |
---|
Ara Sınav | 1 | 35 | Uygulama/Pratik | 1 | 25 | Toplam(%) | | 60 | Yıl İçinin Başarıya Oranı(%) | | 60 | Finalin Başarıya Oranı(%) | | 40 | Toplam(%) | | 100 |
|
AKTS İŞ YÜKÜ |
Aktivite |
Sayı |
Süresi(Saat) |
İş Yükü |
Ara Sınav | 1 | 2 | 2 | Kısa Sınavlara hazırlık | | | | Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi | 14 | 1 | 14 | Final Sınavına Hazırlık | 1 | 30 | 30 | Ders Saati | 13 | 2 | 26 | Ara Sınava Hazırlık | 1 | 25 | 25 | Laboratuvar | | | | Final Sınavı | 1 | 2 | 2 | Ödevler | | | | Uygulama | 13 | 2 | 26 | Toplam İş Yükü | | | 125 |
---|
Toplam İş Yükü / 30 | | | 4,16 |
---|
Dersin AKTS Kredisi | | | 4 |
|
DİL | Türkçe |
STAJ / UYGULAMA | Yok |
| |