Anasayfa  »  Fen Edebiyat Fakültesi »  Moleküler Biyoloji ve Genetik Programı (Türkçe)

DERS ADIDERS KODUYARIYILTEORİ + UYGULAMA (Saat)AKTS
BİYOLOJİK BİLİMLERDE BİLİŞİM TEKNOLOJİLERİ MBG215 Üçüncü Yarıyıl (Güz) 0 + 2 2

DERSİN TÜRÜZorunlu
DERSİN DÜZEYİLisans
DERSİN YILI2
YARIYILÜçüncü Yarıyıl (Güz)
AKTS2
ÖĞRETİM ELEMAN(LAR)IDoktor Öğretim Üyesi Oğuz Balcı
DERSİN ÖĞRENME KAZANIMLARI Bu dersin sonunda öğrenciler;
1) Literatür taramasında internet kullanımını öğrenir.
2) Biyolojik literatür arama motorları ve veri tabanlarında nasıl arama yapılması gerektiğini öğrenir.
3) Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki çeşitli deneysel çalışmalar sonucu elde edilen verileri Excel'deki temel hesaplamaları kullanarak analiz eder ve değerlendirir.
4) Çeşitli deneysel çalışma sonuçlarının gösterimi için Excel programını kullanarak grafik düzenleyebilir ve grafik olarak gösterilen verilere uygun eğri uydurma ve eğri denklemini okuma gibi temel fonksiyonların kullanımını öğrenir.
5) Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki çeşitli çalışmaların sonuçlarını ImageJ programını kullanarak analiz eder ve değerlendirir.
DERSİN VERİLİŞ BİÇİMİYüz Yüze
DERSİN ÖNKOŞULLARIYok
ÖNERİLEN DERSLERYok
DERS TANIMIBu derste öğrenciler, biyolojik literatürün organizasyonunu, moleküler biyoloji ve genetik ile ilgili literatür ve veri tabanlarında arama yapabilmek için gerekli kaynakları ve ihtiyaçları için en uygun kaynağı seçmeyi öğreneceklerdir. Bu derste aynı zamanda lisans öğrencilerine, moleküler biyoloji ve genetik laboratuvar işlemlerinde gerekli olan Microsoft Excel'in temel kavramları ve görüntü analiz programı olan ImageJ uygulamaları tanıtılacaktır.
DERS İÇERİĞİ
HAFTAKONULAR
1. Hafta Biyolojik bilimler ve bilişim teknolojileri ilişkisi
2. Hafta Literatür taramasında internet kullanımı, kütüphane elektronik kaynakların kullanımı
3. Hafta Excel?e giriş ve ekran öğeleri, formüller, veri menüsü işlemleri, standart sapma, ortalama hesaplamaları, grafik çizimi, doğrusal regresyon
4. Hafta Spektrofotometrik ölçümler sonucu elde edilen standart eğriden yararlanılarak yapılan konsantrasyon hesaplamalarında excel kullanımı
5. Hafta Proteinlerin analizleri sonucu elde edilen standart eğriler ve konsantrasyon hesaplamaları
6. Hafta Hücre canlılığı, toksisite ve analizlerinde Excel kullanımı
7. Hafta Hücre sayısı analizinde Excel ve ImageJ kullanımı
8. Hafta Ara Sınav
9. Hafta Bakteriyel hücre büyümesi eğrilerinin oluşturulmasında Excel kullanımı
10. Hafta Nükleik asitlerin analizi ve excel kullanımı: PicoGreen analizi sonucu elde edilen standart eğriden yararlanılarak yapılan DNA konsantrasyon hesaplamaları
11. Hafta Elektroforez uygulamalarında Excel ve ImageJ kullanımı: dansitometri; jel elektroforez ile DNA fragment analizi
12. Hafta Biyolojik veritabanları: NCBI (BLAST, protein model databases, protein structure databases, protein sequence database, nükleotid dizisi veritabanları, RNA dizisi veritabanları)
13. Hafta Real-time PCR Primer ve Prob Tasarımı ve UCSC In-Silico PCR Gen Tarama Aracının Kullanımı
14. Hafta Tartışma
ZORUNLU YA DA ÖNERİLEN KAYNAKLARDers notları, elektronik kaynaklar.
ÖĞRETİM YÖNTEM VE TEKNİKLERİAnlatım,Sorun/Problem Çözme,Soru-Cevap,Tartışma,Eğitim-Uygulama,Sunum
DEĞERLENDİRME YÖNTEMİ VE GEÇME KRİTERLERİ
 SayısıToplam Katkısı(%)
Ara Sınav140
Ödev515
Toplam(%)55
Yıl İçinin Başarıya Oranı(%)55
Finalin Başarıya Oranı(%)45
Toplam(%)100
AKTS İŞ YÜKÜ
Aktivite Sayı Süresi(Saat) İş Yükü
Ara Sınav122
Kısa Sınavlara hazırlık
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi
Final Sınavına Hazırlık11010
Ders Saati13226
Ara Sınava Hazırlık11010
Laboratuvar
Final Sınavı122
Ödevler5210
Toplam İş Yükü60
Toplam İş Yükü / 302
Dersin AKTS Kredisi2
DİLTürkçe
STAJ / UYGULAMAYok
  

PROGRAM YETERLİLİKLERİ (P) / DERSİN ÖĞRENME KAZANIMLARI (Ö) MATRİSİ
Ö1Ö2Ö3Ö4Ö5
P1      X   X   X
P2  X   X      
P3  X   X      
P4      X    
P5  X        
P6  X   X   X   X   X
P7  X   X     X   X
P8  X   X   X   X   X
P9  X   X      
P10    X   X   X   X
P11  X   X      
P12  X   X      
P13  X   X