Bu dersin sonunda öğrenciler; 1) Literatür taramasında internet kullanımını öğrenir. 2) Biyolojik literatür arama motorları ve veri tabanlarında nasıl arama yapılması gerektiğini öğrenir. 3) Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki çeşitli deneysel çalışmalar sonucu elde edilen verileri Excel'deki temel hesaplamaları kullanarak analiz eder ve değerlendirir. 4) Çeşitli deneysel çalışma sonuçlarının gösterimi için Excel programını kullanarak grafik düzenleyebilir ve grafik olarak gösterilen verilere uygun eğri uydurma ve eğri denklemini okuma gibi temel fonksiyonların kullanımını öğrenir. 5) Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki çeşitli çalışmaların sonuçlarını ImageJ programını kullanarak analiz eder ve değerlendirir.
DERSİN VERİLİŞ BİÇİMİ
Yüz Yüze
DERSİN ÖNKOŞULLARI
Yok
ÖNERİLEN DERSLER
Yok
DERS TANIMI
Bu derste öğrenciler, biyolojik literatürün organizasyonunu, moleküler biyoloji ve genetik ile ilgili literatür ve veri tabanlarında arama yapabilmek için gerekli kaynakları ve ihtiyaçları için en uygun kaynağı seçmeyi öğreneceklerdir. Bu derste aynı zamanda lisans öğrencilerine, moleküler biyoloji ve genetik laboratuvar işlemlerinde gerekli olan Microsoft Excel'in temel kavramları ve görüntü analiz programı olan ImageJ uygulamaları tanıtılacaktır.
DERS İÇERİĞİ
HAFTA
KONULAR
1. Hafta
Biyolojik bilimler ve bilişim teknolojileri ilişkisi
2. Hafta
Literatür taramasında internet kullanımı, kütüphane elektronik kaynakların kullanımı
3. Hafta
Excel?e giriş ve ekran öğeleri, formüller, veri menüsü işlemleri, standart sapma, ortalama hesaplamaları, grafik çizimi, doğrusal regresyon
4. Hafta
Spektrofotometrik ölçümler sonucu elde edilen standart eğriden yararlanılarak yapılan konsantrasyon hesaplamalarında excel kullanımı
5. Hafta
Proteinlerin analizleri sonucu elde edilen standart eğriler ve konsantrasyon hesaplamaları
6. Hafta
Hücre canlılığı, toksisite ve analizlerinde Excel kullanımı
7. Hafta
Hücre sayısı analizinde Excel ve ImageJ kullanımı
8. Hafta
Ara Sınav
9. Hafta
Bakteriyel hücre büyümesi eğrilerinin oluşturulmasında Excel kullanımı
10. Hafta
Nükleik asitlerin analizi ve excel kullanımı: PicoGreen analizi sonucu elde edilen standart eğriden yararlanılarak yapılan DNA konsantrasyon hesaplamaları
11. Hafta
Elektroforez uygulamalarında Excel ve ImageJ kullanımı: dansitometri; jel elektroforez ile DNA fragment analizi
12. Hafta
Biyolojik veritabanları: NCBI (BLAST, protein model databases, protein structure databases, protein sequence database, nükleotid dizisi veritabanları, RNA dizisi veritabanları)
13. Hafta
Real-time PCR Primer ve Prob Tasarımı ve UCSC In-Silico PCR Gen Tarama Aracının Kullanımı